Já andei dando uma olhada no fórum sobre esse assunto e o pessoal sempre fala em implementações diferentes da mesma coisa e tal mas nunca chega no ponto alvo, porque utilizar cada um! Será apenas questão de gosto??? Parece que o Mojarra é mais rápido? MyFaces é mais bonitinho, se integra melhor com outras ferramentas Apache? Mesmo que seja gosto, alguém já utilizou os dois para dar as impressões de cada um…
Para vocês verem, sempre utilizei a implementação padrão (Mojarra) e nunca senti falta de utilizar a outra, na verdade, sabia que existia mas confundia pensando que era a mesma coisa, nunca vi nem trabalhei com quem utilizasse MyFaces…
Valeu! 