Converter arquivo de texto com caracteres para outro arquivo de texto em binario

Acho que esse tópico antigo pode te ajudar:

<aside class="quote quote-modified" data-post="3" data-topic="334026">
  <div class="title">
    <div class="quote-controls"></div>
    <img alt="" width="20" height="20" src="/user_avatar/www.guj.com.br/dragoon/40/99515_2.png" class="avatar">
    <a href="https://www.guj.com.br/t/converter-texto-para-binario-mas-problema-com-caracteres-estranhos/334026/3">Converter texto para binário, mas, problema com caracteres estranhos?</a> <a class="badge-wrapper  bullet" href="/c/programacao/java">Java</a>
  </div>
  <blockquote>
    Código correto: 
<a href="http://ideone.com/fork/RveDPx">DEMO</a> 
public String ToBynaryString(String value) throws UnsupportedEncodingException
{
        String result = "";        
        byte[] bytes = value.getBytes("UTF-8");
        StringBuilder binary = new StringBuilder();
        for (byte b : bytes)
        {
           int val = b;
           for (int i = 0; i < 8; i++)
           {
              binary.append((val & 128) == 0 ? 0 : 1);
              val <<= 1;
           }
           binary.append(' ');
        }        
   …
  </blockquote>
</aside>