Java x c# ?

Uma coisa é uma coisa, outra coisa é outra coisa.

.NET é uma plataforma para execução de códigos escritos em C#, VB.NET, F# e por aí vai.
Java não roda em .NET.
Java roda em JVM.

Não existe melhor ou pior.
Existe aquela que resolve seu problema.
Mas para descobrir isso você precisa detalhar bem seu projeto: será Web ou pode ser Windows Form? Tem que rodar só em Windows ou em Linux e Mac também? Precisa de uma versão mobile?
E por aí vai.

Dá uma refletida sobre seu projeto e poste aqui novamente com tudo o que o seu sistema deve fazer.
Aí sim você vai obter a resposta desejada.

Entendi, boa resposta kkk é porque vou criar um software comercial, só preciso rodar em windows, vou pensar o que disse: Obrigado!

Legal!
Mas se é um software comercial, talvez compense pensar em fazer rodar em Linux também, pois você pode ganhar seu cliente apenas informando que ele não precisa de uma licença Windows para rodar sua aplicação, que pode ser uma máquina Linux (gratuita).
Mas isso é só uma dica.
Dá uma pesquisada sobre Business Model Canvas antes de começar o projeto.
Isso pode lhe ajudar bastante.

Se achar que alguma resposta minha lhe ajudou e se achar correto, poderia marcar como solução, por favor?

como assim? haha

Pense que você vai desenvolver um sistema de portaria de uma fábrica que tem 7 portarias.
Se você fizer um sistema que só roda em Windows seu cliente precisará comprar 7 licenças Windows só para rodar sua aplicação.
Agora, se você fizer um sistema que roda em Linux, ele não precisará gastar dinheiro com licenças.

Se teu software é para uma empresa específica que usa Windows, não precisa se complicar com Java, usa .NET/C#.