VS 2015 O arquivo já está sendo usado por outro processo

Dê mais detalhes, qual tipo de aplicação pelo menos? Genericamente falando, o processo que você está executando ficou preso por algum motivo. Veja no gerenciador de tarefas do Windows se ele não está lá. Terá que investigar porque a aplicação não está fechando corretamente.

bom eu sei que coloquei no .net, mas estou usando application forms.

E quando mando rodar em “Debug” a primeira vez (mesmo mandando um Stop na própria IDE) eu preciso novamente “startar” a aplicação.

Bom num tenho muito o que falar, pois é no start e no stop do VS 2015.

Se o processo não está na memória (verificando se está no gerenciador de tarefas) e você não consegue rodar nem na primeira vez (reiniciando a máquina e visual studio), então tente criar uma aplicação do zero para testes e ter ser certeza se o problema é no visual studio ou na sua aplicação, e assim ter melhor foco.