Alias Certificado Digital Duplicado

//Procedimento de listagem dos certificados digitais  
	    public String[] funcListaCertificados(boolean booCertValido) throws NoSuchProviderException, IOException, NoSuchAlgorithmException, CertificateException {  
	  
	        //Estou setando a variavel para 20 dispositivos no maximo  
	        String strResult[] = new String[20];  
	        Integer intCnt = 0;  
	  
	        try {  
	            KeyStore ks = KeyStore.getInstance("Windows-MY", "SunMSCAPI");  
	            ks.load(null, null);  
	  
	            Enumeration<String> aliasEnum = ks.aliases();  
	  
	            while (aliasEnum.hasMoreElements()) {  
	                String aliasKey = (String) aliasEnum.nextElement();  
	  
	                if (booCertValido == false) {  
	                    strResult[intCnt] = aliasKey;  
	                } else if (ks.isKeyEntry(aliasKey)) {  
	                    strResult[intCnt] = aliasKey;  
	                }  
	  
	                if (strResult[intCnt] != null) {  
	                    intCnt = intCnt + 1;  
	  
	                }  
	  
	            }  
	  
	        } catch (KeyStoreException ex) {  
	            Nfe nfe = new Nfe();
	            nfe.setErro(ex.getMessage());
	            Log.logs(nfe, "Carregar Certificados");
	        }  
	  
	        return strResult;  
	  
	    }

System.setProperty("javax.net.ssl.keyStoreProvider", "SunMSCAPI");
			System.setProperty("javax.net.ssl.keyStoreType", "Windows-MY");

			System.setProperty("javax.net.ssl.keyStoreAlias", alias);
			System.setProperty("javax.net.ssl.keyStorePassword", senha);