Gerar .jks e .cer a partir do Windows-MY

Metodos exec = new Metodos();
            try {
                exec.loadCertificates(certi.getSenha(), certi.getAlias(), jtfSaidaCER.getText());
            } catch (Exception e) {
                JOptionPane.showMessageDialog(null, "Erro ao gerar arquivo CER!!" + e, "ERRO", JOptionPane.INFORMATION_MESSAGE);
                System.out.println("Erro ao gerar arquivo CER!!! " + e);
            }

public void loadCertificates(String senha, String aliasIn, String out)
            throws FileNotFoundException, KeyStoreException, IOException,
            NoSuchAlgorithmException, CertificateException,
            UnrecoverableEntryException, NoSuchProviderException {

        //inicialização da variavel que recebera o certificado
        X509Certificate cert = null;

        //inicialização do KeyStore que lista os certificado existentes no "Windows-MY"
        KeyStore kspkcs12 = null;
        kspkcs12 = KeyStore.getInstance("Windows-MY", "SunMSCAPI");

        //Carregado o KeyStore com os valores nulos, pois não tenho o caminho físico do arquivo
        kspkcs12.load(null, null);

        //Verifica se dentro do KeyStore existe o alias passado como parâmetro (foi selecionado pelo cliente na tela anterior).
        System.out.println("Contém Alias Desejado?: " + kspkcs12.containsAlias(aliasIn));


        //Cria uma lista com todos os Alias contido dentro do KeyStore
        final Enumeration<String> eAliases = kspkcs12.aliases();

        //Contador
        int cont = 0;

        //Enquanto houverem registros irá executar o código a baixo
        while (eAliases.hasMoreElements()) {
            //Se contém o alias desejado então executa a operação a baixo
            if (kspkcs12.containsAlias(aliasIn)) {
                //Insere dentro de cert o certificado capturado do KeyStore
                cert = (X509Certificate) kspkcs12.getCertificate(aliasIn);
            }
            //Contador =+ contador;
            cont = cont + 1;
            //Move para o próximo registro
            eAliases.nextElement();
        }

        //Nessa parte do código tento escrever na saida 'out' passada por parâmetro a chave publica do 'cert'
        try {
            File file = new File(out);
            ObjectOutputStream output = new ObjectOutputStream(new FileOutputStream(file));
            output.writeObject(cert.getPublicKey().toString());
        } catch (Exception e) {
            System.out.println(e.toString());
        }
    }